En este nuevo titulo desarrollado de nuevo por Insomniac Games, nos sitúa cronológicamente en el momento en el que Ratchet tiene como misión principal rescatar a Clank de las garras del Dr. Nefarious. Durante esta arriesgada misión, ambos héroes descubrirán su verdadero origen y la llegada de nuevos personajes, un familiar del propio Ratchet.