Al contrario que sus predecesores de arcade, R-Type III: The Third Lightning se desarrolló exclusivamente para Super nintendo, aprovechando al máximo el sistema de gráficos "Mode 7" para generar fondos que giran, vibran y dan vueltas.

R-Type III introduce nuevos módulos —el módulo redondo, el módulo ciclón y el módulo sombra— que se pueden acoplar en la parte delantera o trasera de la nave y que multiplican su potencia de disparo, especialmente si los combinas con todas las mejoras.

Además del cañón de ondas cuenta con el hipercañón de ondas, que podremos utilizarlo con moderación, ya que puede sobrecalentar la nave.