Lux-Pain es un juego de aventura e investigación, en la línea de Ace Attorney pero con un argumento y una estética mucho más oscura, con crímenes, sucesos paranormales y organizaciones secretas.

Al parecer, "Silent", un gusano nacido a través del odio y la tristeza, ha infectado a seres humanos y les obligaron a cometer crímenes atroces. Los padres de Atsuki, nuestro protagonista, son las víctimas de tales crímenes. Para vengar a sus padres, Atsuki pasa a través de una operación peligrosa para adquirir Lux-Pain en su brazo izquierdo.