'1954: Alcatraz' regresa al San Francisco de los años cincuenta para contar la historia de Joe, que cumple una condena de cuarenta años por asalto a mano armada en la famosa institución penitenciaria. Por supuesto Joe ansía escapar de "La Roca", pero necesita la ayuda de su esposa Christine para tener alguna posibilidad.

Ella sin embargo, tiene sus propios problemas con los que lidiar: el cómplice del delito, Mickey, amenaza con matarla si no le entrega todo lo que robaron. El problema es que sólo Joe sabe dónde está escondido, y que todos los ladrones de North Beach van a por el preciado botín.